hCov-OC43-Panel Pseudovirus Standard Reference

HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代發(fā)現(xiàn)的，多年來一直被公認(rèn)為引起普通感冒的原因，并在一生中引起頻繁的再感染。在成年人中，這些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4％至15％，在高峰期高達(dá)35％。兒童的年發(fā)病率達(dá)到8％，最高發(fā)病率高達(dá)20％。據(jù)報(bào)道，成人中229E和OC43病毒的感染頻率為每年每100人15至25人不等，其中有80％的感染者是先前具有該感染病毒抗體的人。

根據(jù)CDC和WHO的介紹，針對HCoV-OC43的核酸診斷一般是針對ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E， Gene S更多用于對應(yīng)藥物和疫苗的開發(fā)。NCBI收錄序列為KX344031.1，全長30713bp，基因編碼5個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白：S，M，N，HE和E。

以往針對試劑盒檢測限的性能評價(jià)，一般是選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品，用于性能評價(jià)。但是兩者都具有很明顯的確定，首先體外轉(zhuǎn)錄的RNA，一般是很純，單一，不涉及提取，不符合臨床病毒的微環(huán)境，因此必然造成檢測靈敏度被高估，這也是存在高概率假陰性的主要原因；再次臨床陽性病毒，即使是滅活的病毒，也是存在很大的生物安全隱患，因此要求實(shí)驗(yàn)室級別為P3-P4，大部分開發(fā)診斷試劑盒單位都不滿足改要求，另外臨床陽性病毒也是來源很有限，不能被穩(wěn)定供應(yīng)，反復(fù)用于試劑盒的性能評價(jià)。

有病毒的完整包膜結(jié)構(gòu)，有HCoV-OC43對應(yīng)的核酸序列，但是生物安全風(fēng)險(xiǎn)較低的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品，完美的克服了選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品的缺點(diǎn)，非常適合用于核酸診斷性能評價(jià)的標(biāo)準(zhǔn)品。

構(gòu)建過程：HCoV-OC43基因合成→假病毒包裝→純化→QC檢測（ddPCR）

ORF1ab/RdRP(2783bp)、Gene N(1347bp)、Gene E(255bp)

• 根據(jù)HCoV-OC43冠狀病毒的特點(diǎn)，選取了ORF1ab/RdRP（RNA-dependent RNA polymerase）、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計(jì)3個(gè)區(qū)段的序列，用于假病毒的包裝，3個(gè)區(qū)段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列；

• 科佰生物設(shè)計(jì)了ddPCR體系的引物、探針序列，可不需要構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線的前提下完成對假病毒的QC拷貝數(shù)檢測，非常準(zhǔn)確表征標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù)，而且克服了Q-PCR分析CT值的相對判斷標(biāo)準(zhǔn)的不準(zhǔn)確性；

• 假病毒標(biāo)準(zhǔn)品，無致病性，可再生，質(zhì)控方法可靠，批次間穩(wěn)定，可以長期穩(wěn)定制備和供應(yīng)，而且要求實(shí)驗(yàn)室生物安全級別為P2，滿足很多單位的安全需求。

ORF1ab/RdRP:

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Gene N:

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GTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTATACTGAAGACACCTCAGAAATATAA

Gene E:

ATGTTTATGGCTGATGCTTATCTTGCAGACACTGTGTGGTATGTGGGGCAAATAATTTTTATAGTTGCCATTTGTTTATTGGTTACAATAGTTGTAGTGGCATTTTTGGCAACTTTTAAATTG

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